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Le C.Y.G.N.E soutient activement les associations de patients suivantes:
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- Crohn et Colite Suisse https://www.crohn-colitis.ch/
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- Association Romande pour la Coeliaquie https://www.coeliakie.ch/
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- Ligue Suisse contre le Cancer https://www.liguecancer.ch/
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- Laufteam Lila https://laufteam-lila.ch/
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- S-Endo https://s-endo.ch/
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- MarCHeton http://www.marchethon.ch/
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- Sclérodermie.CH https://sclerodermie.ch/
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- Osmotility https://osmotility.com/
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